El PCR, es la técnica básica para amplificar el ADN antes de utilizarlo en casi todas las técnicas actuales de biología molecular, desde la manipulación genética hasta el diagnóstico clínico y pruebas forenses como las que vemos en CSI. Por ello, el hecho de que el grupo de Naohiro Noda haya conseguido hacerla más eficiente, rápida y barata es un avance realmente interesante.

Hasta ahora, para poder cuantificar con exactitud la cantidad de ADN con el que se trabaja, se incluían unas moléculas que emiten luz fluorescente al incorporarse al ADN que se está generando. Así, tras lanzar la reacción, el tiempo transcurrido hasta que se puede detectar la fluorescencia en el ADN copiado indica la cantidad de ADN que había en la muestra de partida.

Este ADN puede ser de virus o bacterias encontrados en pacientes, alimentos u otros materiales, por lo que es importante que la detección sea lo más específica posible. No podemos decirle a alguien que tiene el sida cuando no es verdad o asegurar que no hay E. coli en las espinacas y causar un buen brote de diarrea. El problema es que las moléculas usadas actualmente también emiten luz cuando se unen entre ellas. Y esto pasa de vez en cuando.

Para solucionar estas limitaciones, han recurrido a la estrategia contraria, detectar la desaparición de la fluorescencia. Usando dos moléculas, una fluorescente y otra no, la desaparición de este tipo de luz sólo se produce cuando las moléculas se unen al ADN copiado y no entre ellas. Así consiguen aumentar la especificidad y la rapidez de la detección.

Por otro lado, la misma molécula fluorescente puede usarse sea cual sea la secuencia de ADN que se quiera copiar. La especificidad se debe a la molécula no fluorescente. Esto, además de reducir el coste del proceso, evita tener que diseñar dos moléculas para cada experimento, sólo es necesario la mitad del esfuerzo.

Referencias:
Tani, H., Miyata, R., Ichikawa, K., Morishita, S., Kurata, S., Nakamura, K., Tsuneda, S., Sekiguchi, Y., & Noda, N. (2009). Universal Quenching Probe System: Flexible, Specific, and Cost-Effective Real-Time Polymerase Chain Reaction Method Analytical Chemistry DOI: 10.1021/ac900414u